Hacer backup de IIS es muy importante, mucho más de lo que a simple vista parece, ya que su metabase puede contener información que nos haga reinstalar un software entero en caso de liarla. Así que cada vez que haya un cambio de configuración, por mínimo que sea, recomiendo hacer un backup. Hay dos maneras:

1. Vale con hacer una copia de la carpeta %windir%\system32\inetsrv\config
2. Con línea de comandos es más sencillo, ejecutar:

• %windir%\system32\inetsrv\appcmd.exe add backup "Nombre de Backup"
• %windir%\system32\inetsrv\appcmd.exe restore backup "Nombre de Backup"
• %windir%\system32\inetsrv\appcmd.exe delete backup "My Backup Name"
• %windir%\system32\inetsrv\appcmd.exe list backup

Ahora solo queda hacer el backup del Estado de Sistema (recomendación, hacerla semanal) para guardar esta información. Creo que no hacen falta más explicaciones...